Este sistema es una alternativa a las conjugaciones convencionales entre proteínas de interés (antígenos) y fluorocromos; estas conjugaciones son directas en el sentido de que se crea un enlace entre las dos moléculas. El dextrano ofrece ciertas ventajas sobre el método convencional:

1. 1. Reconocimiento eficaz del antígeno. El antígeno no se conjuga directamente con el fluorocromo, lo que a menudo dificulta el reconocimiento debido al impedimento estérico, sino que se une a la estreptavidina y queda distante y reconocible debido al espacio creado entre las moléculas a lo largo del dextrano. Esto mejora enormemente la unión antígeno-receptor. Es preferible que el antígeno esté monobiotinilado para no comprometer la zona de reconocimiento.

   2. Presentación optimizada del antígeno. Es más eficaz porque se trata de un multímero; hay numerosas moléculas de antígeno en el dextrano, por lo que es más probable que se reconozcan una o varias y la unión es más estable.

   3. Amplificación de la señal. Permite discriminar la población positiva de la negativa con cantidades muy bajas, ya que la presentación y el reconocimiento están optimizados y no se necesita un título demasiado elevado.

   4. Bajo marcaje inespecífico. Al no tener que añadir cantidades elevadas para separar la población específica, el marcaje inespecífico se reduce significativamente, agrupándose e identificándose.

   5. Detección de poblaciones minoritarias. Todas las cualidades anteriores contribuyen a poder discriminar poblaciones muy pequeñas (por debajo del 0,5%) con alta resolución.

   6. Conjugación rápida y eficaz. Al basarse en un sistema biotina-estreptavidina, la conjugación sólo dura 30 minutos; es necesario probar diferentes cantidades para establecer la mejor proporción de proteína biotinilada y dextrano, pero no se requieren pasos de purificación, ya que la mejor proporción ofrece la máxima eficacia sin pérdidas.

E-F-G) En una conjugación convencional, pueden darse tres situaciones con respecto a la unión: unión correcta (E), unión problemática (F) y ausencia de unión (G). Esto ocurre porque la conjugación es aleatoria y el sitio de unión puede ser más o menos accesible; esto no ocurre en el dextrano (como se ve en C).

A) Observamos que no es necesario añadir una gran cantidad de dextrano para etiquetar correctamente la población específica, ya que se trata de una unión eficiente. Esto significa que evitamos añadir demasiado reactivo que provoque un marcaje inespecífico y, por lo tanto, conseguiremos una separación óptima.

B) Con una cantidad baja de reactivo, no tenemos una separación suficiente porque tenemos un marcaje inespecífico, bien por la proteína o bien por el fluorocromo. Esto ocurre, sobre todo, porque la conjugación proteína-fluorocromo no es eficiente y tenemos moléculas que no son funcionales, pero sí provocan uniones inespecíficas, lo que nos obliga a aumentar el título para unir la célula específica.

C) Si aumentamos el título (o lo optimizamos), podemos conseguir una mejor separación, pero con el riesgo de aumentar la unión inespecífica por exceso de reactivo. La separación no es tan eficaz como con el dextrano.